新乡医学院1998年经国务院学位委员会批准，获得硕士学位授予权，2004年获得同等学力人员申请硕士学位授予权。365体育投注研究生教育覆盖了医学、理学、教育学、法学、管理学、工学、文学7个学科门类，形成了以医学为主，多门类、多学科协调发展的学科建设和研究生教育格局。
现有基础医学、临床医学、药学等12个一级学科硕士学位授权点，临床医学、公共卫生、护理等10个专业硕士学位授权点。同时，经教育部批准学校设置了人文医学、职业生涯发展教育2个交叉学科。365体育投注研究生教育始终坚持教学科研并重，不断凝炼学科方向，科研水平和科技创新能力大幅度提升，形成了神经与精神卫生、肿瘤免疫、组织再生、干细胞工程技术、环境污染与健康等特色鲜明的研究方向。
学校建设了一支结构合理、素质优良的导师队伍。现有导师1248名，博士生导师58人，正高级职称681人，副高级职称431人，高级职称占导师总数的89.1%，具有博士或硕士学位的导师占88.2%，其中全国优秀教师、全国模范教师、国务院政府特殊津贴享受者、河南省学术技术带头人等300余人。学校加强导师队伍建设，严格遴选导师，严格执行导师考核制度，并把导师考核结果与招生培养紧密挂钩，实行导师动态上岗制度。
学校建有国家级学科创新引智基地、博士后科研工作站、院士工作站和河南省分子诊断与医学检验技术协同创新中心、河南省生物精神病学重点实验室等30余个省部级以上科研基地，为各学科研究生提供了一流的科研创新平台。
学科建设方面：临床医学进入ESI全球学科排名前5‰，入选国家双一流专业；药理学与毒理学学科进入ESI全球排名前1%；拥有A类河南省特色学科群-精神神经医学学科；有临床医学、医学检验技术、护理学和药学等4个国家级特色专业。获批为国家临床医学专业综合改革试点和国家卓越医生培养计划试点单位，建有3个国家住院医师规范化培训基地，2个国家全科医师临床培养基地，1个国家临床药师培训基地，为各专业研究生的成长和专业理论学习及技能训练提供了良好的学习平台。
围绕“规范”与“卓越”两大主题，在全校师生的共同努力下，研究生教育得到迅速的发展,近年来投入研究生科研创新经费500多万元；课程思政200多万元。获得全国首批“临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革”试点单位，河南省首批研究生教育创新基地。
近年来招生规模逐步扩大，优秀生源比例明显增加，生源来自国内外100多所高等院校。
研究生教育教学改革方面：2020年至今，获得河南省教育厅研究生教育改革与质量提升工程项目36项，河南省重大、重点等教育教学改革研究与实践项目十余项，获评高等教育教学成果奖4项。
新乡医学院研究生学院获首批 “河南省学位与研究生教育先进单位”荣誉称号。
随着培养质量的稳步提升，研究生高质量学术成果数量逐年攀升：2018年以来获得河南省优秀硕士学位论文达32篇；SCI收录论文819篇，中文论文1044篇。
围绕“开放”与“交流”两大主题，与马来西亚理科大学联合开展博士培养项目，与印度、尼泊尔联合开展硕士培养项目。鼓励并支持研究生参加国外的学术研讨、交流活动
，拓宽365体育投注研究生国际化视野和良好风貌，同时搭建了365体育投注和国外知名高校之间的交流平台。
研究生就业率历年一直稳定在100%，主要就业于国内三级甲等医院，就业竞争指数全省高校第五，工作与专业相关度全省高校排名第一。
研究生教育将紧密围绕学校建设“特色鲜明的现代化医科大学”的要求，不断加强内涵建设，改革管理运行机制，创新培养模式，提升培养质量，强力支撑新乡医学院办学水平和核心竞争力提升。